Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms