Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL9P32969 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL9P32969 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL9P32969 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL9P32969 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL9P32969 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL9P32969 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms