Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLIP1P30622 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms