Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPREP23469 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPREP23469 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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