Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TCEA1P23193 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms