Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms