Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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