Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBDO15205 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBDO15205 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBDO15205 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBDO15205 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBDO15205 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBDO15205 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBDO15205 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBDO15205 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBDO15205 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBDO15205 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBDO15205 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBDO15205 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBDO15205 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBDO15205 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBDO15205 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBDO15205 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBDO15205 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBDO15205 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBDO15205 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms