Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNPHO15079 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNPHO15079 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNPHO15079 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNPHO15079 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNPHO15079 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNPHO15079 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNPHO15079 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms