Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms