Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP69A5D8W1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms