Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms