Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms