Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms