Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT82Q9NSB4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms