Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPM3Q9HCF6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms