Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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