Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEG8-208ENST00000553465 1176 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms