Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF2Q99805 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms