Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms