Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms