Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A12Q504Y0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms