Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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