Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NEDD8Q15843 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NEDD8Q15843 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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