Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NCF4Q15080 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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