Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EEA1Q15075 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEA1Q15075 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms