Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
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