Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms