Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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