Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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AP3B2Q13367 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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AP3B2Q13367 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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