Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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GPS1Q13098 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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