Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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