Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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