Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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