Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms