Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms