Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPCQ01831 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPCQ01831 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPCQ01831 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms