Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms