Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP9P55211 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP9P55211 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms