Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDST1P52848 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms