Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA5P52803 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms