Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF9P41273 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF9P41273 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF9P41273 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF9P41273 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF9P41273 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF9P41273 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF9P41273 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF9P41273 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF9P41273 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF9P41273 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF9P41273 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms