Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms