Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms