Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms