Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBP1P32455 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GBP1P32455 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms