Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPS1P31327 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPS1P31327 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPS1P31327 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms