Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms