Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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