Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms